Xã Thiệu Vân được chia thành 6 làng: Cổ Ninh, Đại Lý, Hiền Lâm, Phúc Hoà, Xóm 8 Đồng Mẹ, Vân Lập.

Hiện nay xã Thiệu Vân gồm các làng:[3]

1. Vân Tập: từ đầu thế kỉ 19 đến trước năm 1945 là Vân Liễu, thuộc tổng Đại Bối.
2. Cổ Ninh: đầu thế kỉ 19 là trang Cổ Ninh;
3. Đại Lý: tên gọi từ đầu thế kỉ 19;
4. Hiền Lâm: từ đầu thế kỉ 19 đến trước năm 1945 là thôn Phúc Lâm và thôn Chuyên thuộc tổng Đại Bối. Sau năm 1945 sáp nhập thành làng Hiền Lâm;
5. Phúc Hòa: trước đây là làng Cầu Cài;
6. Xóm 8 Đồng Me: mới thành lập.